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Esta coloração é a técnica mais econômica para pesquisar células cancerosas, principalmente quando procedentes do útero (através do exame da secreção vaginal) e brônquios através do exame do escarro, e para indicar ao cirurgião a biopsia em casos suspeitos. No caso de derrame da pleura, do pericárdio e do peritônio, a maior aplicação reside na pesquisa de células cancerosas, sobretudo metastáticas. Além da identificação das células cancerosas, o método de PAPANICOLAU é aplicado para verificar as alterações hormonais do ciclo menstrual (citologia hormonal), a cromatina sexual em esfregaços da mucosa oral e para diagnósticos de diversos agentes etiológicos, sobretudo fungos, tanto nos esfregaços vaginais quanto no escarro.
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